Populations oí Isoetes velata were studied in order to provide more information on their habitat and distribution in the Western and Northwestern Iberian Peninsula. Habitat together with morphology of megaspores were used as diagnostic features. The form I. velata subsp. velata f. lereschii is considered here as a synonym oil velata subsp. asturicense and therefore only two taxa remain within the species: I. velata subsp. velata and I. velata subsp. asturicense. Intermediate individuals have been found in the Western Central System. The differentiation within the I. velata group appears to be the result of gradual genetic divergence after isolation. Palaeobotanical data confirm the presence oil. velata subsp. asturicense in Late Glacial lake sediments in northwestern Spain. Cluster classification of the soft-water vegetation with Isoetes velata subsp. asturicense revealed two main groups in the Spanish Central System. A single association, the Sparganio angustifolii-Callitrichetumfontqueri which includes Iberian Atlantic stands oiSparganium angustifolium and Isoetes velata subsp. asturicense, is here recognized. Besides, a variant of the association with Eleocharis acicularis is identified in shallow temporary waters in the Western Sierra de Gredos. Keywords: glacial lakes, Iberian Peninsula, Isoetaceae, soft-water vegetation, spore morphology. Se han estudiado poblaciones de Isoetes velata con el fin de aportar información sobre su habitat y distribución en el oeste y noroeste de la Península Ibérica. El habitat junto con la morfología de las megasporas se utilizaron como caracteres diagnósticos. La forma I. velata subsp. velata i. lereschii se considera aquí como sinónimo de I velata subsp. asturicense y, por lo tanto, solo quedan dos taxones dentro de la especie: I. velata subsp. velata e I velata subsp. asturicense. Se han encontrado individuos intermedios en el Sistema Central occidental. La diferenciación dentro del grupo I. velata parece ser el resultado de una divergencia genética gradual después del aislamiento. Los datos paleobotánicos confirman la presencia de I velata subsp. asturicense en sedimentos de lagos del Tardiglaciar en el noroeste de España. La clasificación numérica de la vegetación con Isoetes velata subsp. asturicense reveló dos grupos principales en el Sistema Central español. Se reconoce aquí una única asociación, Sparganio angustifolii-Callitrichetumfontqueri, que incluye comunidades atlánticas ibéricas de Sparganium angustifolium e Isoetes velata subsp. asturicense. Además, se identifica una variante de la asociación con Eleocharis acicularis en aguas temporales poco profundas de la Sierra de Gredos Occidental. Palabras clave: lagos glaciares, Península Ibérica, Isoetaceae, vegetación de aguas oligotróficas, morfología de esporas.